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第三章 四不像的样品标本(第1页)

第二天,我是被提拉到的6楼。对虽然我看着有点瘦,但是身高在那里呀,大胡子就直接提这我的领子就提上了楼,单手。哎有点严重打击到我,我需要去健身一下吗?然后我还被吼了……

“叫你来帮我做实验,等了一个早上都不见你。你在3楼猫着,干嘛!“

“我一直在3楼等你做试验呀”理直气壮的吼回去,我的实验室在3楼,我当然在3楼等着。

“昨天和你说了实验室在6楼,6楼,6楼……”大胡子看来没有什么耐心。

“你只是说药物和你做实验,没有说在哪里,昨天你和路桑榆相亲相爱来着,没有说。”大胡子皱眉,不搭理我……

“开始实验!”叹息。

“好”。

大胡子丢给我一个活体样本,然后说:“先做一个全基因组重测序测试,然后结果尽快给我。”

“目前已知的基因组序列的物种我的电脑库存不够,无法准确对比。”

“不用你现在使用的系统,我已经给安装了新的程序和实验资料权限,在那边的新手环上。”

看着我的新手环,特别高大上,通透果绿漂亮的玉制光泽。立马戴上打开,N级的浏览权限,比我现在的权限高了3个档,挖太给力了。立马制订我的实验方案。全基因组重测序是通过对已知进行不同个体的基因组重测序和序列比对,可以找到大量的SNPSingleNucleotidePolymorphism)、InDelInsertionDeletion、CNVCopyNumberVariation等信息,从而进行个体或群体的基因组的差异性分析,在植物育种研究、遗传进化分析及重要性状候选基因预测方面,具有重要的科研和产业价值。

全基因组重测序我做过很多回了,这次也是驾轻就熟的。制定好方案和排列好设备后就是样品提取了,虽然现在科技发达,大部分的基础材料已经可以由试验机器人做,但是原始的提取工作却还是手工的成功率大很多。基因是个有趣的东西,它对自己的性格并不比对环境拥有更大的决定权。“很可能这颗星球上的一切梦想,都是由于生命本身的密码“,基因无法破译生命的密码,而基因密码却预先规定了它对各种事情的反应方式。

拿着我手里四不像的样品标本,我不懂这是什么生物。这是一个半软体半硬体类圆形物体,边缘像经过精细加工一样十分的光滑,大小大约只有5公分;硬体有点像威尼斯共和国送给佛朗索瓦一世的那些美丽贝壳,巴黎圣修佩斯教堂有两个巨大的圣水池就是用那种贝壳做的,在阳光下闪闪发光,美丽非常。

先用高倍显微镜观察了一下它。软体部分的样子非常奇异,一团黏肉上有许许多多的触手,触手上有吸盘,触手晃荡的样子有点像海里珊瑚触手,外形像笛子一般,只等着海神波塞冬来吹。

硬体贝壳在显微镜下有一层层花朵般的图腾,花形也不是随意排列,是组成了五色斑斓的图案却又集聚几何色彩,显微镜探头再往深处去,硬体具有层次变化,一层比上面的一层有更多的几何图案,而且图案越来越复杂,只是颜色黯淡了些。大胡子和我说过不允许我切片实验,这就给我出了难题,软体部分还好,看起来就是统一的物质,形态也统一。硬体这么细密的层次,和不是特别明显可确认的同一物质的特征,让我对我的实验方案不得不进行调整。

我先对软体进行样品基因组的提取,提取样为DNA5μgOD260280为1820,30×基因组大小的测序深度,这是初测,如果结果的基因组复杂程度较高或SNP准确率不理想的话,再适当加深测序深度。文库构建——上机测序——原始测序数据——数据质控——数据分析,一套流程下来也不是一天二天可以完成的。反正大胡子没有规定我时间,我决定慢慢来。

哈哈不过我对这四不像的样品标本很好奇,它不像星球上有的东西,而且硬体部分上的图案让我有点莫名的烦躁和熟悉,我难得对一个什么东西感兴趣,好奇害死猫的事情在我身上出现比较少,因为懒不再多想,下班,今天要去市区耍耍。像这样偏僻的实验室呆久了,是会傻的,为了不让自己早日痴呆,定期我都会出去放松一下。

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